В этой версии текста о Кулундинской степи найдём придаточные с «которого», «где», «которая» и «которые». Не пропустим предложение 9: в нём придаточное соседствует с сочинительной связью.
Шаг 1. Определим, что нужно сравнить
В 4, 6, 8 и 9 запятыми отделены придаточные определительные части. В 9 сочетание «которые расположены вперемежку» обязательно учитываем: это отдельная часть с основой.
Шаг 2. Разберём каждое предложение
(1) — не входит в выбранную группу
Кулундинская степь – самый низкий и самый маловодный район Алтая.
Запятых нет. Однородные характеристики района соединены «и» после тире.
(2) — не входит в выбранную группу
Из четырёх сотен рек равнинной части только около полусотни питают эту местность.
Запятых нет. Количество рек выражено сочетанием «около полусотни» внутри одной части.
(3) — не входит в выбранную группу
Многие из них сезонно пересыхают, оставляя в руслах лишь мелкие озёрца.
«Оставляя в руслах лишь мелкие озёрца» — деепричастный оборот. Запятая обособляет добавочное действие рек.
(4) — входит в ответ
Озёра Кулундинской степи – это остатки древнего моря, дном которого некогда была Кулундинская впадина.
«Дном которого некогда была Кулундинская впадина» — придаточная часть к слову «моря». Её основа «впадина была дном», а союзное слово «которого» находится не в самом начале части. Запятая нужна перед всей частью, перед «дном».
(5) — не входит в выбранную группу
Озёр насчитывается более двух тысяч.
Запятых нет. Основа передаёт количество озёр без придаточного пояснения.
(6) — входит в ответ
На Приобском плато, где сохранились ложбины древнего стока, проложили русла современные равнинные реки Барнаулка, Касмала, Кулунда, Бурла.
«Где сохранились ложбины древнего стока» — придаточное к «плато», выделенное парой запятых. Остальные запятые перечисляют названия рек. В ответ включаем за границы придаточного.
(7) — не входит в выбранную группу
А в наследство от древних ледниковых вод и рек осталось множество озёр, характерно узких и вытянутых в длину.
«Характерно узких и вытянутых в длину» — обособленные согласованные определения после слова «озёр». Собственной грамматической основы у них нет; это не придаточная часть.
(8) — входит в ответ
Большинство озёр степного Алтая имеет солёную или горько-солёную воду, которая обладает лечебными свойствами.
«Которая обладает лечебными свойствами» — придаточное определительное к слову «воду». Перед союзным словом стоит запятая на границе частей.
(9) — входит в ответ
Пресные только проточные или искусственные водоёмы, которые расположены вперемежку, и разделяют их порой лишь небольшие перешейки.
После «водоёмы» открывается придаточное «которые расположены вперемежку». Запятая перед «и разделяют» закрывает его и совпадает с границей перед следующей сочинённой частью. В этой карточке 9 входит в ответ именно из-за придаточного с «которые».
Шаг 3. Запишем ответ
Общее правило: запятые при придаточных частях. Ему соответствуют предложения 4, 6, 8, 9. Записываем их номера подряд без повторов, пробелов и разделителей: 4689.
Ответ:4689
ФИПИ: навигатор по пунктуации