Пояснение относится к Петроградскому университету. Оно начинается словами «после окончания которого», хотя союзное слово стоит не первым.
Шаг 1. Найдём грамматические основы и части предложения
Главная основа — «интересы сформировались»; придаточная — «он был оставлен».
Шаг 2. Проверим каждую цифру
(1) — без запятой
…Научные интересы С.М. Бонди (1) сформировались ещё во время обучения…
«Научные интересы С.М. Бонди» — группа подлежащего, «сформировались» — сказуемое. Между ними запятой нет.
(2) — ставим запятую
…время обучения в Петроградском университете (2) после окончания которого он был…
«После окончания которого он был оставлен при кафедре» — придаточное к университету. Ставим запятую перед «после окончания».
(3) — без запятой
…в Петроградском университете после окончания (3) которого он был оставлен при…
Не разрываем «после окончания которого»: речь об окончании университета.
(4) — без запятой
…Петроградском университете после окончания которого (4) он был оставлен при кафедре.…
После «которого» продолжается придаточная основа «он был оставлен». Дополнительный знак не нужен.
Текст с запятыми на указанных местах
Научные интересы С.М. Бонди сформировались ещё во время обучения в Петроградском университете, после окончания которого он был оставлен при кафедре.
Шаг 3. Запишем ответ
Запятые нужны на местах (2). Места (1), (3), (4) оставляем без запятых по разобранным связям. Записываем цифры подряд без повторов и разделителей: 2.
Ответ:2
ФИПИ: навигатор по пунктуации